消化科设有病区、专科门诊、脂肪肝专病门诊、内镜中心、胃肠电图诊疗室、¹³C呼气试验室、胃肠起搏室等部门。常规开展胃、食管疾病的内窥镜诊断、结肠疾病的内窥镜诊断、无痛胃肠镜检查、内镜下食管及胃内异物取出、胃结石粉碎术、内镜下消化道息肉切除、消化道出血的内镜下治疗、胃肠起搏、胃肠电图检查、¹³C呼气试验。